Zhruba tři sta smutečních hostů bylo vpuštěno do síně pět minut před jedenáctou hodinou. Obřad probíhal bez účasti médií.
Premiér Petr Nečas po pohřbu rychle odjel. "Zemřel velký vědec, jeho práce bude žít dál," řekl krátce novinářům.
"Měli jsme spolu blízký vztah, i když jsme nebyli blízcí spolupracovníci. Konec proběhl nečekaně brzy, hlava mu myslela úžasně do poslední chvíle. Mohl ještě spoustu věcí udělat," řekl iDNES.cz předseda Akademie věd Jiří Drahoš.
S Holým se přišel rozloučit i Miroslav Hlavatý, který vede Dům světla pomáhající lidem s AIDS. "Spoustě našich klientů pomohl prodloužit život," řekl iDNES.cz. "Přišel jsem mu poděkovat. Díky němu žiju plnohodnotný život. Lék téměř nemá vedlejší účinky," doplnil Hlavatého spolupracovník Petr Sobek, který je nakažený virem HIV.
Nečas na pohřeb dorazil v 10:45. Krátce se pozdravil s Jiřím Drahošem a zamířil do sálu. "Je mi to líto. Mohl dotáhnout do konce řadu dalších věcí, které měl rozpracované," uvedla vicepremiérka Karolína Peake, jež se piety též zúčastnila.
Za obrovskou ztrátu pro českou vědu označil Holého smrt ministr zdravotnictví Leoš Heger. Na pohřbu se objevil i předseda Senátu Milan Štěch.
Dorazilo mnoho Holého kolegů a přátel, například Zdeněk Havlas, bývalý ředitel Ústavu organické chemie a biochemie Akademie věd, kde Holý pracoval od roku 1960.
Pohřeb zorganizovala Holého rodina. Ještě před ním pracovník pohřební služby řekl reportérce iDNES.cz, že obřad bude poměrně krátký. Zazněly na něm čtyři skladby, promluvil například Drahoš.
Holého preparáty jsou součástí nejúčinnějších a zároveň dostupných léků proti AIDS, viru pravých neštovic, pásovému oparu, virovému zánětu oční sliznice a proti virové hepatitidě typu B.
